Иногда это вызвано тем, что Linux использует символы в именах файлов, которые недопустимы в Windows. Например, можно сохранить файл с вопросительным знаком (?) на его имя в Linux (даже в разделе NTFS). Однако Вы не можете открыть его в Windows, и если Вы выполните chkdsk, то Windows удалит файл и помещает его в папку по имени Found.nnn в корне диска с другим именем, которое может стать действительно хитрым для нахождения.
После нескольких дней попыток и испытаний решение (или проблема) очень простое: убедитесь, что у вас есть /
точка монтирования внутри ваших зашифрованных томов - в противном случае сценарий init-bottom
вызывается сразу после сценариев init-premount
(поскольку /
не нужно расшифровывать).