Надо было проверить "другое программное обеспечение". Если вы этого не сделали, то, скорее всего, все эти записи есть.
Вы также можете проверить свои файлы source.list
на случай, если где-то:
grep security /etc/apt/sources.list /etc/apt/sources.list.d/*
Редактируйте свои файлы с помощью любимого редактора, используя root.
Это не большая часть проблемы, для которой Вы найдете справку здесь, но она больше походит на ошибку в этом программном обеспечении, о котором нужно сообщить в bugtracker проекта.