Вы упомянули, что используете файловую систему FAT32. FAT, как и NTFS, являются FSes с нечувствительным к регистру. Я предполагаю, что драйвер делает заглавные буквы только для того, чтобы убедиться, что в dir с таким же именем (хотя и с другим корпусом) нет >1 файла.
Описываемая вами проблема существует уже некоторое время. См., например, эта резьба из 2008 г.
Я предлагаю использовать другой FS или использовать архивы TAR на дисках FAT/NFTS для сохранения корпуса.
.
Проблема заключалась в том, что я не скопировал последние 512 байт последнего сектора. Таким образом, последний раздел был неполным. При копировании еще одного сектора все смонтировано правильно.