Убедитесь, что контрольные суммы UDP и IP4 полученных пакетов верны. Включите вычисление контрольной суммы в wirehark и проверьте захват.
Благодаря предложению Andras Deak мне удалось решить эту проблему. Ошибка возникает из-за бэкэнда Qt5Agg по умолчанию, который я использовал, и переход на бэкэнд GTK3Agg решил проблему (и дал гораздо лучшее оформление в сеансе Gnome ).
Не знаю, что не так с Qt в моей системе. Одним из недостатков использования GTK3Agg на Wayland является невозможность загрузки темы курсора. Здесь есть обходной путь
https://wiki.archlinux.org/index.php/Cursor_themes
Я просто переключился на xorg для простоты.