Другой подход
awk '{print NR++,$2}' file
Или даже
awk '{$1=NR++}1' file
Похоже, у вас возникла проблема с аппаратным устройством NVMe. Вы можете попробовать загрузиться с USB-образа восстановления и запустить badblocks
на устройстве NVMe, или, если есть диагностический инструмент Samsung для стирания/тестирования устройства, вы можете запустить его?