Программа IM для поддержки видеовызовов Yahoo

Если целый диск шифруется, и некоторый инструмент перед начальной загрузкой просит, чтобы пользователь ключ дешифровал его, разве который не означает, что этот инструмент должен работать под ОС, которую это собирается загрузить?

Да, в значительной степени. Основанное на аппаратных средствах полное шифрование диска делает это: шифрование обрабатывается полностью устройством (жесткий диск / флэш-память) или возможно в контроллере вдоль продвижения цепочки к физическому устройству (устройствам) и не "видимо" к ОС.
С этим ОС делает ввод-вывод точно как он, был бы, если это имело дело с плоскостью, незашифрованным устройством, волшебство происходит в аппаратных средствах (и/или встроенное микропрограммное обеспечение - "ниже" ОС в любом случае).

Если нет такого инструмента, разве который не означает, что инструмент дешифрования так или иначе должен передать информацию о дешифровании ОС на начальной загрузке?

Должна была бы быть некоторая форма передачи информации действительно, если шифрование не может быть сделано "под" ОС (или как выше, или возможно использование методов виртуализации – но затем Вы сортируете, имеют два (или больше) выполнение Ose). И да, который означает, перекрестная ОС тверда.
Вам также будет нужен код boostrap (загрузчик по крайней мере), чтобы быть незашифрованными, если у Вас не будет помощи аппаратных средств/встроенного микропрограммного обеспечения.

Статья шифрования диска Википедии имеет больше об этом.