Обнаружена проблема:
Это была глупая проблема с RAID, у нас была (fakeRAID) настройка, которая каким-то образом была сломана, поэтому она представляла два диска в linux fdisk и обнаружила, что grub был записан на обоих дисках.
Решение заключалось в том, что когда вы используете fakeRAID, вам нужен специальный модуль ядра драйвера, также вам необходимо отключить модуль AHCI
при установке Linux, поэтому я добавил blacklist=ahci
в кикстарт PXE. файл, и это устранило все проблемы.