1- вам нужно узнать, что это за файловая система.
2- проверьте, что файловая система восстановлена. Сделайте это в какой-нибудь проприетарной системе или попробуйте с помощью fsck
(но Linux не может восстановить все файловые системы)
3- тогда я думаю, что вы можете либо удалить каталог, либо каталог пропал (потому что он уже был частично удален).
Я предполагаю, что ваша файловая система находится в несогласованном состоянии.