Я думаю, VIM не распознает файл подкачки как принадлежащий к отредактированному файлу.
Файл подкачки VIM содержит путь к редактированному файлу. Это имеет смысл, поскольку вы можете иметь файлы подкачки в другом каталоге, чем отредактированный файл. По-видимому, Vim проверяет, что путь в найденном Swapfile соответствует файлу для редактирования. Это не будет в вашем случае, поскольку один путь находится в VM Linux, а другой путь находится под Windows.
К сожалению, я не мог найти доказательство этой теории в руководстве по VIM, и у меня сейчас нет времени, чтобы проверить его в источниках.
Ваш профиль, вероятно, называется как-то вроде (скрытый). Попробуйте запустить:
$ netctl disable netctl-if[something]@enp4s0.service