Если у вас нет реальной причины, я бы не стал восстанавливать себя из исходников. yum install
намного быстрее и проще.
Второй :, если вы запускаете что-то вроде
./configure
make
make install
то эти файлы не будут учитываться базой данных rpm
; поэтомуrpm
(и, следовательно,yum
)не будут знать, что эти файлы существуют.