Большое спасибо за Ваши ответы.
Решение состояло в том, чтобы подготовить установку к набегу 1, но просто смонтировать один HDD в набеге.
(Активные устройства: 2, зарезервированные устройства: 0, но просто SDA и не SDA + SDB)
Это решило проблему с пересинхронизацией, и установщик обычно работал.
После установки debian я просто добавил второй HDD к своему набегу:
mdadm --add /dev/md0 /dev/sdb1 (this for every partition)
Результат: пересинхронизирующая скорость увеличена с 750 К (в установщике) к 70 000 К в рабочей системе.
Если вы в конечном итоге пойдёте по маршруту, вам следует взглянуть на некоторые вещи вроде [1121319]patchelf[1121320], чтобы обновить интерпретатор. Это позволит вам навсегда изменить интерпретатор быстро и безопасно. [1120902]