x11vnc аварийно завершает работу на сигнале 11 (ошибка сегментации )вскоре после подключения клиента

Это возможно в bash, но это действительно не очень хороший инструмент для этого:

#!/bin/bash 

# Read the sequence into the variable $seq
seq=$1

## Check all three frames
for ((frame=0; frame<=3; frame++)); do
  ## Read the sequence in groups of 3
  for ((i=$frame;i<=${#seq};i+=3)); do
    ## The codon: three nucleotides starting from the current position.
    codon=${seq:i:3}
    ## set isORF to 1 if this is an ATG
    if [[ ${seq:i:3} = "ATG" ]]; then 
      isORF=1
    fi
    ## If we're in an ORF
    if [[ $isORF = 1 ]]; then
      ## Add this codon to the ORF's sequence
      ORF="${ORF}${codon}"
      ## Is this a STOP?
      if [[ ${seq:i:3} = "TGA" ||
            ${seq:i:3} = "TAA" ||
            ${seq:i:3} = "TAG" ]];
      then
        ## Print the ORF
        echo "ORF: $ORF"
        ## Set isORF to 0 and empty the ORF variable to repeat the process
        isORF=0
        ORF=""
    fi
  fi
  done
done

Сохраните это как foo.sh, сделайте его исполняемым(chmod a+x foo.sh)и запустите так:

/path/to/foo.sh AAAGCATATGCTAGCCCGTATAGCGATACTAGCTATACGATATATATGATCAATGCCCGTATAG