Не удается войти в систему с правами root на уровне выполнения 3

Кажется, это хорошо работает:

$ tr "|\n" "\n," < input | sed 's/^,//;s/,$//'
9000,3000,1000,0000,0000,2000,1000,2000
5669000,518000,3000,16000,0000,28000,2241000,2841000
9020000,453000,520000,4000,2852000,5191000,75000

Мы используем trдля перевода |s в новые строки, а символы новой строки — в ,s. Затем мы берем результирующий вывод и удаляем начальные или конечные ,с sed.