Попробуйте это,
find. -type f -maxdepth 1 -exec bash -c '[[ $(wc -l < "$1") -gt 1 ]] && rm "$1"' _ '{}' \;
. -type f -maxdepth 1
для поиска файлов в текущем каталоге $(wc -l < "$1") -gt 1
проверить, больше ли количество строк, чем 1 rm "$1"' _ '
удалять файлы только в текущем каталоге.