Я бы выбрал что-то вроде этого:
список каталогов на стороне idx1:cd idx1/defaultdb; find. -type d > path/to/list.txt
список каталогов на стороне idx2:cd idx2/defaultdb; find. -type d >> path/to/list.txt
awk 'seen[$1]++ {print $1}' path/to/list.txt
Примечание:
find
должны будут выполнять запись в один и тот же файл. Выберите его путь соответственно.