Для команд с псевдонимами нет сохранения -, поэтому, если вы назовете псевдоним l ls, а затем выйдете из bash, псевдоним будет потерян.
Если вы хотите, чтобы они сохранялись, поместите их в ~/.bashrc
Ну, сам Gnome не предоставляет дока по умолчанию. Вы, вероятно, говорите о каком-то расширении, разработанном сообществом, например. Рывок к причалу или что-то подобное. В этом случае определите, какое расширение вы используете, и создайте новую задачу в соответствующем трекере задач. Всегда лучше сначала связаться с разработчиками и только если они не отвечают, создавать вопрос на форумах.