Как я могу получить старые метаданные пакета Debian?

-pruneисключает содержимое каталога, но не сам каталог. Это происходит, если -pruneявляется единственным действием в команде find. Если бы было какое-либо другое действие (, например. -execили -print), он не будет выводить сокращенные имена каталогов. Так что вам просто нужно добавить явное -printв конце вашей команды find. Например:

find./ \( -path "*work*" -o -path "*ncvlog_lib*" \) -prune -o -type f  \
  -not -name "*.wlf" -not -name "*.vcd" -not -name "*.sim" -not -name "*vcs*" \
  -print

Кстати, вы можете сократить/упростить команду find, используя один предикат -regex, а не несколько предикатов -name. например.

find./ \( -path "*work*" -o -path "*ncvlog_lib*" \) -prune -o -type f \
  -regextype awk -not -regex '.*\.(wlf|vcd|sim)$|.*vcs.*' -print

Это производит выходные данные, идентичные тому из первой версии выше.