Наконец-то нашел ответ на свой вопрос.
Решение состоит в использовании overlayfs в сочетании сbindfs , что позволяет монтировать одну папку как другую папку с разными правами доступа/владельцем/и т.д.
# sudo bindfs --map=origOwner/newOwner:@origGroup/@newGroup /srcFolder /dstMountpoint
mkdir /data/prod-overlay/dev1/prod # mountpoint
sudo bindfs --map=prod/dev1:@prod/@dev1 /data/prod-overlay/dev1/overlay /data/prod-overlay/dev1/prod