Сегодняшние обновления, кажется, исправили это. В любом случае спасибо за ваши ответы и любые подсказки о том, какой пакет (s )вызвал проблему, по-прежнему приветствуются.
осмотревшись, я нашел вариант --best
:
dnf --best install package
всегда будет устанавливать последнюю версию.