Как эта резервная копия правильно выполняется в Linux, через rsync или копирование?

Awk раствор:

awk 'NR==1{ h=$0 }NR>1{ print (!a[$2]++? h ORS $0 : $0) > $2".txt" }' file

• NR==1{ h=$0 }-захватить 1-ю строку/запись как заголовок строка(NRуказывает на номер записи,$0-содержит текущую строку)
• NR > 1-для всех записей, кроме первой :
  • <cond>? <operand_1> : <operand_2>-классический тернарный оператор
  • !a[$2]++?-проверка первого вхождения штрих-кода значения $2, используемого в качестве ключа ассоциативного массиваa
  • h ORS $0-общая строка заголовка, объединенная сORS(разделителем выходных записей, по умолчанию\n)и текущей записью$0
  • print... > $2".txt"-печатать пользовательское содержимое или текущую строку (, если ничего не было указано )в файл<barcode_value>.txt

Или более самостоятельная -объяснительная версия:

awk 'NR==1 {header = $0; next}
     !header_printed[$2]++ {print header > $2".txt"}
     {print > $2".txt"}' < file

Просмотр результатов:

$ head TCGA*.txt
==> TCGA-BD-A2L6-01A-11D-A20W-10.txt <==
Hugo_Symbol Tumor_Sample_Barcode    Entrez_Gene_Id  Center  NCBI_Build
MTHFR   TCGA-BD-A2L6-01A-11D-A20W-10    4524    BCM GRCh38
SLC30A1 TCGA-BD-A2L6-01A-11D-A20W-10    7779    BCM GRCh38
USH2A   TCGA-BD-A2L6-01A-11D-A20W-10    7399    BCM GRCh38
SOS1    TCGA-BD-A2L6-01A-11D-A20W-10    6654    BCM GRCh38

==> TCGA-G3-A7M5-01A-11D-A33Q-10.txt <==
Hugo_Symbol Tumor_Sample_Barcode    Entrez_Gene_Id  Center  NCBI_Build
PRDM16  TCGA-G3-A7M5-01A-11D-A33Q-10    63976   BCM GRCh38
DNAJC11 TCGA-G3-A7M5-01A-11D-A33Q-10    55735   BCM GRCh38
HNRNPCL2    TCGA-G3-A7M5-01A-11D-A33Q-10    440563  BCM GRCh38
C1orf94 TCGA-G3-A7M5-01A-11D-A33Q-10    84970   BCM GRCh38
NFYC    TCGA-G3-A7M5-01A-11D-A33Q-10    4802    BCM GRCh38
IPP TCGA-G3-A7M5-01A-11D-A33Q-10    3652    BCM GRCh38

==> TCGA-O8-A75V-01A-11D-A32G-10.txt <==
Hugo_Symbol Tumor_Sample_Barcode    Entrez_Gene_Id  Center  NCBI_Build
TMEM51  TCGA-O8-A75V-01A-11D-A32G-10    55092   BCM GRCh38
FLG TCGA-O8-A75V-01A-11D-A32G-10    2312    BCM GRCh38
FLG TCGA-O8-A75V-01A-11D-A32G-10    2312    BCM GRCh38

Настройка имени файла на основе последовательности из 15 -символов значения штрих-кода :

awk 'NR==1{ h=$0 }NR>1{ print (!a[$2]++? h ORS $0 : $0) > substr($2, 1, 15)".txt" }' file