Корень имеет полный доступ RW ко всей файловой системе. Также, чтобы изменить разрешения для каталога, вы должны изменить разрешения для файла .
в этом каталоге.
У меня нет хорошего ответа на этот вопрос, кроме как после пары перезагрузок и сброса шрифтов по умолчанию, он волшебным образом исправился сам.