Запустить кикстарт-запуск с работающего Live CD?

Если установлено locate и выполняется ежедневное задание cron updatedb для обновления списка, и оно выполнялось до rm а не после, вы могли бы попытаться:

locate -0 ~/\* | perl -l -0 -ne 'print unless lstat$_'

получить представление об ущербе.

То есть найти в базе данных locate файлы, которых там больше нет.

С помощью GNU locate (не mlocate) вы можете сократить его до:

locate -E ~/\*