Я тоже столкнулся с такой проблемой. Вышеприведенный ответ предназначен только для одного файла, но если вы хотите игнорировать многие, да.
Вы можете использовать
sudo rm -r /path/to/directory
для удаления всех защищенных от записи обычных файлов
Это определяется в ini настроек из тем.
Например
cat /usr/share/themes/Albatross/gtk-3.0/settings.ini
[Settings]
gtk-color-scheme = "base_color:#ffffff\nbg_color:#ededed\ntooltip_bg_color:#d6dce4\nselected_bg_color:#a9b7c4\ntext_color:#444444\nfg_color:#202020\ntooltip_fg_color:#222222\nselected_fg_color:#333333"
gtk-auto-mnemonics = 1
gtk-visible-focus = automatic
Заменить автоматический на ложный.
Изменить: правильный файл, но неправильный ключ gtk-enable-tooltips = false