отключить загрузку в rtorrent

Если вы используете систему, в которой есть утилиты GNU, вы всегда можете использовать basename , чтобы удалить расширение:

$ basename -s ".mkv" GameOfThronesS01E05.mkv                                                          
GameOfThronesS01E05

В противном случае python тоже всегда будет хорошим выбором:

$ python -c 'import sys;print sys.argv[1][:-4]' GameOfThronesS01E05.mkv                               
GameOfThronesS01E05