Вопросы Теги

Преобразование матрицы с размерностью (nxn) в матрицу с комбинацией строка*столбец

Вы можете искать по имени процесса. А затем посмотреть на сокеты домена unix (возможно, абстрактные), открытые процессом, чтобы определить номер дисплея. 

pid=$(pgrep -xt "$tty" Xorg) &&
  lsof -aUp "$pid" | sed '\|.*X11-unix/X\([0-9]\{1,\}\) .*|!d;s//\1/;q'

Этот lsof придется запускать от имени root.

Или вы можете извлечь номер дисплея из аргументов командной строки, если он всегда там: 

pgrep -axt "$tty" Xorg | sed -n 's/.*:\([0-9]\{1,\}\).*/\1/p'
1
08.08.2016, 16:57
3 ответа

Чтобы напечатать только верхние треугольные значения в соответствии с желаемым результатом 

awk '
  NR==1 {
    split($0,hdr," "); next
  } 
  {
    for (i=NR;i<=NF;i++) {print $1 FS hdr[i] FS $i}
  }
' file
snp1 snp1 1
snp1 snp2 0.3
snp1 snp3 0.4
snp1 snp4 0.5
snp2 snp2 1
snp2 snp3 0.4
snp2 snp4 0.5
snp3 snp3 1
snp3 snp4 0.5
snp4 snp4 1

или эквивалентным образом, с помощью perl 

perl -alne '
  if ($. == 1) {
    @hdr = @F;
  } else {
    for $i ($.-1 .. $#F) {
      print join " ", $F[0], $hdr[$i], @F[$i];
    }
  }' file

Если вам нужна полная матрица, а не только верхний треугольник , затем измените начальный индекс цикла for , заменив NR (в версии awk) на 2 или $ .- 1 ] (в версии perl) на 1

2
27.01.2020, 23:25

UPDATE

Сейчас ограничений нет. 

#!/bin/bash

INPUT=File1
declare -a fields

fields=( $(head -n1 "$INPUT") )

i=0
while read -r line; do
    values=( $line )
    for ((j=++i; j<${#values[@]}; j++)); do
        echo -e "${fields[$i]}" "${fields[$j]}"'\t'"${values[$j]}"
    done
done < <( tail -n+2 "$INPUT")
1
27.01.2020, 23:25

Это должно быть легко с помощью awk . 

$ awk -f script.awk file1.txt
snp1 snp1 1
snp1 snp2 0.3
snp1 snp3 0.4
snp1 snp4 0.5
snp2 snp1 0.3
snp2 snp2 1
snp2 snp3 0.4
snp2 snp4 0.5
snp3 snp1 0.4
snp3 snp2 0.4
snp3 snp3 1
snp3 snp4 0.5
snp4 snp1 0.5
snp4 snp2 0.5
snp4 snp3 0.5
snp4 snp4 1

Содержание script.awk . Пропускаем первую строку и форматируем остальные по желанию. 

$ cat script.awk
{
if (NR == 1) next;
print $1" snp1 "$2;
print $1" snp2 "$3;
print $1" snp3 "$4;
print $1" snp4 "$5;
}

Содержание file1.txt 

$ cat test.txt 
____   snp1  snp2   snp3   snp4
snp1    1     0.3   0.4    0.5  
snp2    0.3     1   0.4    0.5
snp3    0.4   0.4     1    0.5 
snp4    0.5   0.5   0.5      1

Таким образом, вы можете перенаправить вывод в новый файл. 

awk -f script.awk file1.txt > file2.txt
0
27.01.2020, 23:25

Теги

Похожие вопросы