После установки firefox nightly с помощью flatpak, когда я пытаюсь запустить его, он запускает обычный firefox

При вызове xrandr вы можете добавить - масштаб 2x2 для вывода без HiDPI. Это отобразит отображаемое изображение в высоком разрешении, но уменьшит его перед отображением на мониторе. Это не всегда выглядит красиво, но его можно использовать. Например, я расширяю свой внутренний дисплей Retina 2560x1600 eDP-1 внешним монитором без HiDPI DP-1 :

#!/bin/sh
EXT=`xrandr --current | sed 's/^\(.*\) connected.*$/\1/p;d' | grep -v ^eDP`
xrandr --output eDP-1 --auto --pos $(((3840-2560)/2))x2400 --scale 1x1 \
       --output "$EXT" --auto --scale 2x2 --pos 0x0

См. Также эту суть ].