Вы используете относительные пути в скрипте
. Итак, вам необходимо соответствующим образом изменить текущий рабочий каталог в материнском скрипте
перед вызовом скрипта
.
# motherscript
cd 001
./script
То же самое случилось со мной после обновления clang с 3.8.0 до 3.8.1.
Я установил последнюю библиотеку llvm, и она сработала :)
dnf install llvm