Способность не удаляет автоматически установленные пакеты
Я полагаю, что большинство из них делает, в чем Вы нуждаетесь, инструкция относительно того, как установить ОС с зашифрованным HD во-первых.
Ubuntu имеет хорошую страницу с инструкциями относительно создания зашифрованных разделов, LMVPs, папки и т.д., просто гуглят Вашу версию дистрибутивов этого...
Этим поведением управляет опция Apt::AutoRemove::SuggestsImportant.
Опция: Кв.:: AutoRemove:: SuggestsImportant
Значение по умолчанию: верный
Описание: Если эта опция будет верна, то способность не будет полагать, что пакеты не использованы (и таким образом автоматически не удалит их), как долго, поскольку любой установленный пакет предлагает их. Для получения дополнительной информации посмотрите раздел, названный, “Управляя автоматически установленными пакетами”.
http://aptitude.alioth.debian.org/doc/en/ch02s05s05.html#configApt-AutoRemove-SuggestsImportant
Можно установить эту опцию на ложь в одном из конфигурационных файлов способности, чтобы позволить способности автоматически удалить пакеты, которые только предлагаются другими пакетами. Например, редактирование или создает/etc/apt/apt.conf и добавляет следующую строку
Кв.:: AutoRemove:: ложь SuggestsImportant;