Обратите внимание на положение символа фона и
:
test.sh >> log_file 2>&1 &
Perl в помощь!
Сохраните элементы списка в хэш, затем прочитайте таблицу, разделите на пробельные символы и проверьте хэш, чтобы вывести 0 или 1.
#!/usr/bin/perl
use warnings;
use strict;
my %in_list;
open my $LIST, '<', 'mylist.tab' or die $!;
while (<$LIST>) {
chomp;
$in_list{$_} = 1;
}
open my $TAB, '<', 'data.tab';
while (<$TAB>) {
my @cells = split;
print shift @cells, "\t";
print join "\t", map $in_list{$_} ? 1 : 0, @cells;
print "\n";
}
Другое решение perl
$ perl -lne 'if(!$#ARGV){ $h{$_}=1 }
else{ s/\h\K\H+/$h{$&} ? 1 : 0/ge; print }
' mylist.tab data.tab
Info_1 0 1 1
Info_2 1 0
Info_3 1
Info_4 1 0 0 0 1
Info_5
if (! $ # ARGV) {$ h {$ _} = 1}
построить хэш слов в mylist.tab
s / \ h \ K \ H + / $ h {$ &}? 1: 0 / ge
для строк в data.tab
, замените на 1
, если он присутствует в переменной хеширования, иначе 0
. \ h \ K
является положительным просмотром назад на наличие пустого места, что позволяет избежать совпадения первого столбца Это прямо выражено в awk:
awk 'FNR==NR { h[$1]; next } { for(i=2; i<=NF; i++) $i = ($i in h)? 1 : 0 } 1' mylist.tab data.tab
Или в более читаемом формате:
parse.awk
# Collect mylist.tab into the `h` associative array
FNR==NR {
h[$1]
next
}
# For all but the first column in data.tab check and record if it is in `h`
{
for(i=2; i<=NF; i++)
$i = ($i in h) ? 1 : 0
}
# Short for { print $0 }
1
Запустите его следующим образом:
awk -f parse.awk mylist.tab data.tab
Output:
Info_1 0 1 1
Info_2 1 0
Info_3 1
Info_4 1 0 0 0 1
Info_5
Или для столбцов с разделителями табуляции:
awk -v OFS='\t' -f parse.awk mylist.tab data.tab
Output:
Info_1 0 1 1
Info_2 1 0
Info_3 1
Info_4 1 0 0 0 1
Info_5
Используйте sed
для создания сценария sed
из mylist.tab и запуска его на data.tab:
sed \
-e '1i s/^[ \\t]*//' \
-e 's@\(.*\)@s/\\([ \\t]\\)\1\\b/\\11/@g' \
-e '$as/\\([ \\t]\\)[^ \\t]\\{2,\\}\\b/\\10/g' mylist.tab \
> /tmp/x.sed
sed -f /tmp/x.sed data.tab
Примечание Я предполагаю, что все строки в "mylist.tab" имеют не менее 2 символов.