невозможно запустить ни одну программу: trap int3 ip error

Вы можете отсортировать по положению символа (обозначенному цифрой после . ) поля (здесь поле 1) :

sort -k1.6 -k1.4,1.5n -k1.1,1.3 file.txt 

Пример:

$ cat file.txt 
foo03a
foo02b
foo01a
foo02a
foo01b
foo03b

$ sort -k1.6 -k1.4,1.5n -k1.1,1.3 file.txt 
foo01a
foo02a
foo03a
foo01b
foo02b
foo03b

Обратный путь, используя rev :

$ rev file.txt | sort -k1.1,1.1 -k1.2,1.3n -k1.4 | rev
foo01a
foo02a
foo03a
foo01b
foo02b
foo03b