Если у вас уже есть выходные файлы и вам просто нужно добавить заголовок с именами файлов к каждому из них, все, что вам нужно, это что-то вроде:
header=$(printf "%s %s %s %s\n" $(awk 'FNR==1{print FILENAME}' file*))
for file in output*; do
printf '%s\n%s\n' "$header" "$(cat $file)" > tmp &&
mv tmp "$file";
done
Вы можете синхронизировать только файл с fsync или (без изменений метаданных )с fdatasync , только файловую систему с syncfs или все с синхронизировать . А просто каталог? sync /var/log/syslog
— это пример синхронизации только каталога.