XBindkeys не связывает команду xdotool ключей для ключа

IIRC на Ubuntu /boot по умолчанию получает свой собственный раздел. Вы можете попробовать проверить

# sudo cfdisk

строка, выглядящая примерно так, должна быть вашим /boot

sda1        Boot        Primary   Linux ext3                       20530.30

или с

# sudo fdisk -l

она должна выглядеть примерно так

/dev/sda1   *           1        2496    20049088+  83  Linux

вы заметите установленный флаг "Boot", который означает, что это раздел, с которого BIOS пытается загрузить загрузчик... при нормальных обстоятельствах это должен быть раздел /boot.