Я могу совместно использовать папку в своем корневом каталоге с другим пользователем?

На Ваш вопрос трудно ответить точно, потому что Вы не сказали, что соединяет каналом, Вы являетесь передающими демону, и Вы не указали полномочия ~agent. Если Вы запускаете демона в ~agent/incoming каталог и передача это относительные пути, затем так как демон находится в automaton группа, которую это сможет считать, пишут и удаляют файлы в ~agent/incoming каталог.

Я предполагаю то, что происходит:

1. ~agent каталог не является исполняемым файлом демону.
2. Путь, переданный демону, включает ~agent как компонент (говорят, это - полный путь).

Когда процесс доступы /home/agent/incoming/foo, это должно иметь полномочия выполнения на всех каталогах, которые пересечены: /, /home, /home/agent и /home/agent/incoming (больше, если некоторые из них являются символьными ссылками).

Если доступы демона foo в то время как его текущий каталог ~agent/incoming, это только должно иметь полномочия выполнения на текущем каталоге (~agent/incoming) самостоятельно. Необходимо удаться сделать тот каталог текущим; chdir требует, чтобы процесс имел доступ к целевому каталогу. Это возможно, если Вы сначала изменяетесь на желаемый каталог при выполнении, как (говорят) agent пользователь, затем выполняет что-то как su daemon -c daemon-command.