Некоторые из моих приложений всегда запускаются, когда я вхожу в Linux Mint

Ваша строка:

val=$("$line" | wc -c)

Эта пытается выполнить команду, данную $line и пропустить выход через wc -c . Сообщение об ошибке, которое Вы видите, указывает на то, что он пытается выполнить команду "hellounix", как и в первой строке Вашего файла. Если Вы хотите передать значение переменной в команду вместо нее, Вы можете использовать printf:

val=$(printf '%s' "$line" | wc -c)

Если Вы используете Bash, zsh, или другую более мощную оболочку, Вы также можете использовать здесь stringings:

val=$(wc -c <<<"$line")

выполняет расширение на строке "$line", а затем предоставляет его в качестве стандартного входа wc -c.

Однако в данном конкретном случае можно использовать встроенное расширение параметра оболочки для получения значения длины переменной вообще без трубопровода:

val=${#line}

Расширение # расширяется до:

Длина строки. Подставляется длина в символах значения параметра. Если параметр '*' или '@', то результат расширения не указывается. Если параметр не задан и установлено -u, то расширение будет неудачным.