Почему не может войти в систему в моей debian консоли?

Если вы настраиваете домашний каталог ваших пользователей с помощью adduser, то нет необходимости в chroot - ваши пользователи будут иметь автоматический доступ к своим домашним каталогам с помощью опции local_enable.

Если файлы находятся в другом месте, просто измените их домашний каталог на этот каталог. До тех пор, пока они не ожидают ssh, проблем быть не должно.

Убедитесь, что ваш файл vsftpd.conf имеет:

anonymous_enable=NO
local_enable=YES
write_enable=YES

и не имеет строк chroot. write_enable должен быть NO, если вы не хотите, чтобы ваши пользователи записывали в свои домашние каталоги по FTP.