Вы делаете $_
.
echo 'hey there' &
echo "$_"
hey there
hey there
Попробуйте разделить команду на две строки в вашем .tmux.conf
Откройте окно
neww -n Bash1 bash.
Отправьте команду в окно
send-клавиши -t "Bash1" 'python2.6 python-prog/prog.py' Enter