Файл CSV фильтра на основе расширенных значений столбцов
[112173] Для проверки использования памяти вашей системы вы должны использовать [112508]free[112509].
Для использования:
- Значение под [112510]shared[112511] и [112512]-/+ буферы/кэш[112513] является текущей доступной памятью. В данном случае это 869 МБ. Для получения более подробной информации смотрите [112514]здесь
- Чтобы посмотреть, какие программы установлены, используйте [112516]rpm
1
terdon
11.02.2015, 14:58
Ссылка
3 ответа
Вы можете попробовать следующее:
$ sort -rt"," -k2,3 file.csv |
awk -F, '{a[$2][$3]=$0; if(a[$2][$4]){print a[$2][$4]; print;}}'
RZ_AUTO_7,4tow,131,132,98,99,UC/AC Canonical ribose-zipper
RZ_AUTO_5,4tow,130,131,99,100,AU/CA Canonical ribose-zipper
RZ_AUTO_2,4tov,1405,1406,1517,1518,GU/AA Naked ribose-zipper
RZ_AUTO_1,4tov,1404,1405,1518,1519,CG/AA Canonical ribose-zipper
Объяснение
- Сортировка
-rменяет порядок сортировки (так что сначала печатаются большие числа),-t,устанавливает разделитель полей на,и-kопределяет поля для сортировки.
Что касается сценария awk :
-F,: установите разделитель полей на,.a [$ 2] [$ 3] = $ 0;: это список списков, двумерный массив. Например, для первой строки это будетa [4tov] [1404] = $ 0.a- это просто имя массива.Устанавливается значение текущей строки,$ 0.if (a [$ 2] [$ 4]): если четвертое поле (второй остаток) было замечено связанным с тем же PDBID, что и первый остаток.выведите [$ 2] [$ 4]; print;: распечатать строку, в которой он был замечен (поскольку он был сохранен как значение массиваa) и текущую строку.
У меня нет доступа к OSX для проверки, но, судя по вашему комментарию , похоже, что OSX awk , в отличие от GNU awk , не может справиться с многомерными массивами. Итак, вот то же самое в Perl:
sort -rt"," -k2,3 file.csv |
perl -F"," -ane '$k{$F[1]}{$F[2]}=$_;
print "$k{$F[1]}{$F[3]}$_" if $k{$F[1]}{$F[3]}'
4
27.01.2020, 23:20
Ссылка
через Python3 с использованием модуля RE .
#!/usr/bin/python3
import re
import sys
j = sys.argv[1]
with open(j) as f:
fil = f.read()
m = re.findall(r'(?s)(?:^|\n)([^,]*,([^,]*),[^,]*,([^,]*)[^\n]*).*?\n([^,]*,\2,\3,[^\n]*)', fil)
for i in m:
print(i[0]+'\n'+i[-1])
Сохраните вышеуказанный код в файле с именем Script.py и выполните этот файл, запустив команду ниже на терминале.
python3 script.py inputfile
$ python3 script.py file.csv
RZ_AUTO_1,4tov,1404,1405,1518,1519,CG/AA Canonical ribose-zipper
RZ_AUTO_2,4tov,1405,1406,1517,1518,GU/AA Naked ribose-zipper
RZ_AUTO_5,4tow,130,131,99,100,AU/CA Canonical ribose-zipper
RZ_AUTO_7,4tow,131,132,98,99,UC/AC Canonical ribose-zipper
0
27.01.2020, 23:20
Ссылка