Вопросы Теги

Как Распечатать определенные Поля, если условие соблюдают

[1128682] Я нашел этот инструмент, который точно соответствует моей потребности, называется

logtop

. Согласно документации:

logtop[1129771] отображает в реальном времени количество строк, полученных на стандартном входе.

Примеры

Полезны для некоторых случаев, например, для получения IP-флуда вашего сервера:

Или для верхней жужжащей статьи вашего блога:

Fedora/CentOS/RHEL

  • Нет RPM, который я смог бы найти для этого приложения, но он довольно тривиален для скачивания, компиляции и установки вручную. Для его компиляции требуется установка 2-х зависимостей.
  • Вы можете скачать программу с Github:

Чтобы скомпилировать ее:

ssh user@192.168.x.xxx /path/to/script

Вы можете установить ее или запустить из этого каталога, [1129159]. /logtop[1129160].

Пример

ssh user@dbhost "mysqldump" > dumpfile

1
08.09.2014, 20:17
3 ответа

Входные данные видны ориентированы на абзац, поэтому давайте прочитаем его как абзац вместо строки: 

awk -v RS="\n=\n" '
    /PRIMER_LEFT_NUM_RETURNED=[^0]/ {
        n = split($0, lines, /\n/)
        for (i=1; i<=n; i++) {
            if (lines[i] ~ /^(SEQUENCE_ID|SEQUENCE_TEMPLATE|PRIMER_LEFT_NUM_RETURNED|PRIMER_RIGHT_NUM_RETURNED|PRIMER_INTERNAL_NUM_RETURNED|PRIMER_PAIR_NUM_RETURNED|[^=]+_0[^=]*)=/)
                print lines[i]
        }
        print "="
    }
' input.file

или эквивалент Perl (позволяет более читаемыми «расширенными» регулярными выражениями 

perl -0777 -ne '
    BEGIN {
        $wanted = qr{ 
            ^                  # at the beginning of the string
            (?: SEQUENCE_ID    # match one of these words
               | SEQUENCE_TEMPLATE 
               | PRIMER_LEFT_NUM_RETURNED 
               | PRIMER_RIGHT_NUM_RETURNED 
               | PRIMER_INTERNAL_NUM_RETURNED 
               | PRIMER_PAIR_NUM_RETURNED 
               | [^=]+_0[^=]*
            )
            =                  # followed by an equal sign
        }x
    }

    for (split /^=$/m) {
        if (/PRIMER_LEFT_NUM_RETURNED=[^0]/) {
            print join("\n", grep {$_ =~ $wanted} split /\n/), "\n=\n";
        }
    }

    # or, as a single command:
    #
    # print 
    #     map {join("\n", grep {$_ =~ $wanted} split /\n/) . "\n=\n"}
    #     grep {/PRIMER_LEFT_NUM_RETURNED=[^0]/}
    #     split /^=$/m

' input.file
3
27.01.2020, 23:15

Вы можете установить разделитель записей на \n=\n, то есть новую строку, a =, а затем снова новую строку. Это позволит вам использовать awk по своему усмотрению:

$ awk -v RS='\n=\n' -v OFS="\n" '!/PRIMER_LEFT_NUM_RETURNED=0/{print $1,$2,$3,$4,$5,$6,$7,$8,$9,$10,$11,$12,$13,$14,RS}' file
SEQUENCE_ID=Contig1
SEQUENCE_TEMPLATE=AAGTCGCCCCTCCAT
PRIMER_LEFT_NUM_RETURNED=2
PRIMER_RIGHT_NUM_RETURNED=2
PRIMER_INTERNAL_NUM_RETURNED=0
PRIMER_PAIR_NUM_RETURNED=5
PRIMER_PAIR_0_PENALTY=7.398828
PRIMER_LEFT_0_SEQ=AAGTCGCCCC
PRIMER_RIGHT_0_SEQ=aaaagaca
PRIMER_LEFT_0=0,20
PRIMER_RIGHT_0=69,20
PRIMER_LEFT_0_END_STABILITY=2
PRIMER_RIGHT_0_END_STABILITY=3
PRIMER_PAIR_0_PRODUCT_SIZE=70

=

SEQUENCE_ID=Contig22
SEQUENCE_TEMPLATE=CCGTCGCCCC
PRIMER_LEFT_NUM_RETURNED=3
PRIMER_RIGHT_NUM_RETURNED=3
PRIMER_INTERNAL_NUM_RETURNED=0
PRIMER_PAIR_NUM_RETURNED=5
PRIMER_PAIR_0_PENALTY=7
PRIMER_LEFT_0_SEQ=AAGTCGCC
PRIMER_RIGHT_0_SEQ=agaGAGTA
PRIMER_LEFT_0=0,20
PRIMER_RIGHT_0=69,20
PRIMER_LEFT_0_END_STABILITY=2
PRIMER_RIGHT_0_END_STABILITY=3
PRIMER_PAIR_0_PRODUCT_SIZE=70

=

Это, однако, предполагает, что поля с _0 всегда будут одинаковыми. Если это не так, вы можете сделать что-нибудь вроде:

$ awk -v RS='\n=\n' -v OFS="\n\n" '!/PRIMER_LEFT_NUM_RETURNED=0/{printf "%s\n\n", $0}' file | 
   grep -P 'SEQUENCE_ID|SEQUENCE_TEMPLATE|PRIMER_LEFT_NUM_RETURNED|PRIMER_RIGHT_NUM_RETURNED|PRIMER_INTERNAL_NUM_RETURNED|PRIMER_PAIR_NUM_RETURNED|_0'
2
27.01.2020, 23:15

Прямой путь:

awk '$3 !~ "=0"{print $1,$2,$3,$4,$5,$6,$7,$8,$9,$10,$11,$12,$13,$14,RS}' RS='=\n' FS='\n' OFS='\n' file

После = добавится дополнительная пустая строка, которую можно легко удалить.

1
27.01.2020, 23:15

Теги

Похожие вопросы