Я использую очень hacky метод:
Прокомментируйте все cronjob строки:
echo "$(crontab -l)" | sed -e "s/^/#/g" | crontab
Некомментарий все cronjob строки:
echo "$(crontab -l)" | sed -e "s/#//g" | crontab
Таким образом, если я перезагружаю, это комментируется для того, когда cronjobs запускают снова.