Можно непосредственно изменить ~/.local/share/applications/mimeapps.list
Изменение:
inode/directory=nautilus.desktop
кому:
inode/directory=YourFileManager.desktop
Например:
inode/directory=pcmanfm.desktop
В строке "sudo" запрос "passwd" - для вашего локального пароля, а не для удаленного. Она еще не запустила ssh, потому что sudo еще не аутентифицировала вас.
Удалите строку 3 в вашем файле "known_hosts" и попробуйте еще раз.