Сравните версии того же пакета в различных репозиториях (т.е. стабильный по сравнению с бэкпортами) использование шоу способного кэша

То, что Вы ищете, ntpd с --panicgate опция.

panicgate опция позволяет первую корректировку после ntpd начинает быть любым размером. Это точно для варианта использования, который Вы описали, где машина подходит, и это - часы, дико неточно. Когда ntpd запускается с этой включенной опции, это может занять некоторое время для него, находят сервер и устанавливают синхронизацию с ним.

Та опция сам по себе решает Ваш объект № 1.

2. Ванильный ntpd. Ntpd сохраняет файл дрейфа, который является уровнем расфазировки тактовых сигналов Вашей системы.

3. Также то же как № 1. --panicgate опция не ограничена сразу, когда ntpd запускается, это ограничено "первой корректировкой", каждый раз, когда та корректировка.