Можно также посмотреть в редакторе меню "Приложений" Gnome и удалить дубликаты отсюда.
При обеспечении ключа SSH вручную, он работает?
ssh localhost -i id_rsa
Если так, проблема наиболее вероятна Ваш агент SSH, который не зарегистрировал Ваш новый ключ
Вы могли попытаться использовать следующие выступы команды после вызова команды ssh-keygen:
ssh-copy-id -i id_rsa.pub localhost
Это должно скопировать Ваш открытый ключ в удаленный хост (здесь Ваш собственный компьютер, когда Вы использовали localhost), и активируйте его в надлежащем файле.
Примечание: Иногда и с более старой версией sshd (SSH serveur процесс) файл называют authorised_key, проверьте Вас sshd страница справочника на точное имя.