В системах Fedora (я подозреваю, это - действительно вкусная вещь), можно сделать yum reinstall <package>
переустановить пакет (который должен возместить большинство убытков). И rpm -Va
дает список пакетов с некоторой проблемой (посмотрите на руководство для деталей вывода). По некоторой непостижимой причине это обычно сообщает о различиях даже в недавно установленных пакетах, но это не побеспокоило меня достаточно для исследования далее (все же). В любом случае, если повреждение слишком серьезно, спасите то, что может быть спасено и переустановить, все еще Ваш лучший выбор.
Работавший вокруг путем удаления (или, скорее замены пустым файлом) /usr/share/themes/oxygen-gtk/gtk-2.0/icons4
файл. Затем значки корректны.
Необходимо выбрать тему GTK, которая соответствует спокойной теме. В приложении параметров настройки системы одна из панелей имеет дело конкретно с темой GTK (я не дома и не могу проверить точное имя). Используйте эту панель для корректировки появления приложений GTK.