Необходимо обновить идентификаторы группы при помощи newgrp
.
Это должно сделать то, что Вы хотите:
ls|sed 's/\..*//'|sort -u|column
Если Ваша оболочка имеет ширину Вашего терминала в $COLUMNS, то это лучше:
ls|sed 's/\..*//'|sort -u|column -c $COLUMNS