При использовании GNU Parallel это выглядит так:
parallel --plus iRep -f Bins/{/...}_bin.* -s {} --sort -o {/...}_iRep_output ::: sam/*.sam.sorted.sam
С GNU Parallel это выглядит так:
find. -type f,d |
parallel 'chown $(($(stat --printf %u {})+1)):$(($(stat --printf %g {})+1)) {}'
Я бы использовал zsh
здесь:
#! /bin/zsh -
# enable the stat builtin (which btw predates GNU stat by several years)
zmodload zsh/stat || exit
# enable chown (and other file manipulation builtin)
zmodload zsh/files || exit
ret=0
for f (./**/*(DN.,/).) {
stat -LH s $f && # store file attributes in the $s hash/associative array
chown $((s[uid] + 1)):$((s[gid] + 1)) $f || ret=$?
}
exit $ret # report any error in stat()ing or chown()ing files
(где D
для dotfile — включить скрытые файлы, N
для nullglob — не считать это ошибкой, если файл не найден .,/
является обычным или каталогом, например-type f,d
).
Если в системе GNU, такой как Ubuntu 20.04, вы также можете:
find. -type f,d -printf '%p\0%U\0%G\0' | # print path, uid, gid as 3
# nul-delimited records
gawk -v RS='\0' -v ORS='\0' '{
file = $0; getline uid; getline gid
print (uid+1) ":" (gid+1); print file}' | # outputs a uid+1:gid+1
# and path record for each file
xargs -r0n2 chown # pass each pair of record to chown
Но так как это предполагает запуск одного chown
на файл (в подходе zsh
, мы запускали chown
, встроенный в модуль zsh/files
), это будет намного менее эффективно..