Открыть URL как в браузере из командной строки

Вы можете cdвойти в folderAи запустить команду оттуда:

cd folderA
find. -type d -o -type f -exec bash -c '
  for path; do mkdir -p "/path/to/folderB/${path/file/folder}"; done
' bash {} +

Расширение параметра ${path/file/folder}переименовывает каждый fileXYв folderXY.

Если каждая папка содержит файлы, вы можете удалить -type d -o.