Какая файловая система лучше всего подходит для множества небольших файлов?

Вы не можете использовать MIT -SHM с удаленного клиента X11.

Только подумайте о его аббревиатуре :SHM = разделяемая память. Если клиент и сервер работают на разных машинах, они не могут совместно использовать память.

Предполагается, что это расширение ускорит запросы X11, которые передают много данных, используя API-интерфейс общей памяти SySV вместо записи через сокет (, например.XPutImage->XShmPutImage). Его преимущества на современных компьютерах спорны ИМХО.