Деборфан ложноположительный :libmagickwand -dev :все

Дано:

eval "whole_phrase=$x" # store the whole phrase to another variable

Лучше:

whole_phrase="$x"

И дано:

eval "first_element=echo $x | cut -d';' -f1" # extract the first element after splitting

Есть много способов извлечь первый элемент.

Поскольку вашим разделителем является символ точки или ., передайте его в awkи попросите напечатать только первое поле:

first_element="$(awk -F. '{print $1}' <<< "$x")"

Или, поскольку в этом особом случае вам нужен только первый элемент, легко указать sedудалить первый .символ и все после него:

first_element="$(sed -e 's/\..*//' <<< "$x")"

Наконец, учтите, что пока вы не изменяете переменную x, которую вы читаете из своего файла, у вас уже есть там значение whole_phrase. Действительно, вы могли бы использовать это имя переменной в своем цикле while:

while read whole_phrase
do
    first_element="$(awk -F. '{print $1}' <<< "$whole_phrase")"
    myprogram -i "../$first_element" -o "../$whole_phrase"
done < ListOfDotSeparatedPhrases.txt