В Aptitude удалось переустановить все пакеты с именем PAM.
Таким образом, на вопрос, какие модули следует установить, выбрал все :1 2 3 4, а не только 1.
Затем выполняется dpkg-reconfigure gdm3
для реконфигурации GDM3.
Теперь, кажется, все в порядке.
Пакеты, связанные с X.org, не имеют собственной группы в Fedora. Вместо этого вы могли бы сделать это:
sudo dnf reinstall '*xorg*' 'mesa*' 'libx*' 'libX*' 'fontconfig*'
Это не перезапишет какие-либо файлы в /etc/X11
, поэтому любые изменения, сделанные вами в этом каталоге, сохранятся.