Есть ли способ предотвратить изменение индексов приемника pulseaudio?

Прочитав комментарии, стало ясно, что ваши образцы данных не соответствуют вашим реальным данным (и для начала используются пробелы вместо табуляции, а это означает, что даже вывод команды вашего собственного устройства не будет работать ), но собрав другой входной файл вот так:

cat file.txt
chr1    1197592.       C       A      .      .       DP=67;ECNT=1;NLOD=8.12  GT:AD:AF:F1R2   0/1:37,2:0.063:13,0     0/1:37,2:0.0005:13,0
chr1    1355707.       G       T      .      .       DP=69;ECNT=1;NLOD=4.51  GT:AD:AF:F1R2   0/1:50,3:0.059:20,3     0/1:50,3:0.0005:20,3
chr1    1641723.       TC      T      .      .       DP=59;ECNT=1;NLOD=2.40  GT:AD:AF:F1R2   0/1:30,2:0.089:12,4     0/1:30,2:0.0015:12,4
chr1    2550056.       TC      CT     .      .       DP=99;ECNT=1;NLOD=9.03  GT:AD:AF:F1R2   0/1:63,2:0.053:33,2     0/1:63,2:0.0005:33,2

Затем будут выведены все строки, соответствующие обоим условиям:

awk -F"[  :]" '$15>0.06 && $19>0.001' file.txt
chr1    1641723.   TC  T  .  .   DP=59;ECNT=1;NLOD=2.40  GT:AD:AF:F1R2   0/1:30,2:0.089:12,4 0/1:30,2:0.0015:12,4